Structura unității contabile depinde de tipul de activitate, de mărimea organizației etc.

În condițiile moderne, există trei tipuri principale de structuri contabile: liniară (ierarhică), verticală (liniară-staff) și funcțională (combinată).

În cadrul unei structuri contabile liniare (ierarhice), toți contabilii primesc sarcini și raportează direct contabilului-șef. Această structură este utilizată în organizațiile mici.

Într-o organizare verticală (linie și personal) a departamentului de contabilitate, sunt create unități intermediare de management (departamente, sectoare, grupuri) care sunt conduse de un contabil superior. Contabilii își primesc misiunile de la contabilii superiori de la nivelurile de conducere respective și raportează direct contabililor superiori.